Ученые смогли извлечь последовательности ДНК редких животных

Источник фото: https://phys.org

Новое открытие американских ученых впервые дает возможность получить ДНК из очень старых образцов вымерших видов, таких как белоклювый королевский дятел, тасманский волк и дронт.

Образцы редких и исчезающих животных хранятся в банках со спиртом в музеях естественной истории по всему миру, которые обеспечивают богатство информации об изменении биоразнообразия планеты.

Эти сохранившиеся экземпляры змей, ящериц, лягушек, рыб и других животных могут храниться до 500 лет, обработанные формалином. Формалин помогает сохранить образец, делает его жестким и прочным, но это затрудняет извлечение и секвенирование (последовательность) ДНК. Кроме того, ДНК деградирует и распадается на мелкие фрагменты с течением времени. Эту фрагментированную ДНК трудно увеличить до длинного информативного участка, который можно использовать для изучения эволюционных отношений между видами. Ученым до сих пор не удавалось эффективно секвенировать ДНК этих образцов.

Кристофер Остин, куратор и профессор Музея естествознания при Университете Луизианы, и его коллега Сара Руане из Ратгерского Университета в кампусе Ньюарка разработали протокол и протестировали метод для секвенирования ДНК тысяч генов из таких «непокорных» образцов змеи. Их исследование было опубликовано в международном научном журнале Molecular Ecology Resources.

Остин говорит, что музеи естественной истории являются хранилищами для вымерших видов. К сожалению, натуралисты 1800-х годов не собирали образцы для анализов, которые проводятся сегодня, таких как секвенирование ДНК. Теперь с новыми методами появилась возможность получить ДНК из очень старых образцов и выявить последовательность ДНК вымерших видов.

Остин и Руане нашли и протестировали подход, где берется небольшой кусочек ткани печени от образца змеи и прогревается определенное время. Затем применяется фермент, который «переваривает» образец ткани и позволяет извлечь ДНК.

Ученые извлекли и исследовали ДНК 13 исторических или редких экземпляров змей со всего мира, многие из которых никогда не были проанализированы с помощью современных генетических методов. Некоторые образцы были возрастом более 100 лет.

Исследователи объединили эти данные с современными образцами, чтобы создать генетическое семейное древо, или филогению, которое сопоставляет эволюционные взаимоотношения различных видов змей. Результатом этой работы стали тысячи генетических маркеров для образцов змей, собранных еще в начале 1900-х годов.